No mucho, excepto que hay un trofeo diferente sin valor que ganas por ganar la conferencia. Probablemente, la única otra diferencia, realmente, es que muchos equipos de NFC tienen una historia más larga. Esto se debe a que la NFC está compuesta principalmente por equipos que pertenecían a la NFL original, que tiene sus raíces a principios del siglo XX. La AFC está compuesta por equipos que compitieron en la nueva AFL (Liga de fútbol americano) que comenzó en la década de 1960. En ese momento había una diferencia considerable entre las dos ligas, y la mayoría de la gente sentía que la NFL era superior. Sin embargo, la AFL fue una amenaza para la NFL, ya que cada vez más jugadores universitarios firmaron con la nueva liga.
A finales de los 60 comenzaron a jugar el Super Bowl entre los ganadores de las dos ligas en el primer paso que conduciría a su fusión. Para empezar, fue solo un juego de exhibición, pero rápidamente se hizo muy popular. El líder de Vince Lombardi, Green Bay Packers, era el equipo dominante en la NFL en ese momento, y ganó los dos primeros Super Bowls fácilmente. En el tercero, sin embargo, el extravagante Joe Namath llevó a los nuevos Jets de Nueva York de la AFL a una sorprendente victoria sobre los muy favorecidos Colts de Baltimore de la NFL después de garantizar la victoria a pesar de ser desvalidos de dos dígitos. Esto, más que nada, confirmó que la AFL, de hecho, se había convertido en el par de la NFL en el fútbol americano profesional.
Dos años después, las dos ligas se fusionaron en la moderna NFL. Los Baltimore Colts se mudaron a la nueva conferencia de la AFC junto con todos los equipos originales de la AFL y la mayoría de los equipos de la NFL formaron la nueva conferencia de la NFC. En los años 70, la AFC tenía el mejor equipo con los Pittsburgh Steelers ganando cuatro Super Bowls, seguidos por los equipos de la NFC que ganaron la mayoría de los Super Bowls en la década de 1980 y principios de los 90.
Pero en este punto, realmente no hay mucha diferencia entre las conferencias. Particularmente con el tope salarial y otras reglas que aseguran un campo de juego nivelado entre los equipos de ambas conferencias.
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